Остров Анзерский (шир. 65°09’ N, долг. 36°05’ O) лежит на западной стороне пролива Восточная Соловецкая Салма и отделяется от островов Соловецкий и Большая Муксалма проливом Анзерская Салма.
В восточной части острова возвышается плоская гора высотой 49,9 м с отлогими склонами, которая отделяется от лежащих западнее ее возвышенностей широкой впадиной, идущей к берегам в меридиональном направлении. Из-за наличия этой впадины при подходе с S или N остров Анзерский открывается в виде двух отдельных островов. На вершине горы установлен светящий знак Анзерский.