Есть очень много межвенцовых утеплителей http://vashdom.ru/articles/flaxen_1.htm. Небольшой обзор.
Основные это - пакля, сухой мох, джут. Есть и новые технологии http://spb-orion.ru/germetiki_dlya_derevyann, например герметики на основе акрилового латекса.
Все подробно рассказано и показано: http://vasha-banya.com/karkas/steny_pol/kak-konopatit-srub.html
Жгут бывает разного диаметра,можно подобрать под размер щелей http://www.maxidom.ru/remont_i_stroi...om_np_30mm_3m/ Про него почитать можно здесь http://www.plastex.ru/catalog/shnuri_i_profil_tilit/

Как отреставрировать сруб. Порядок действий http://www.rubim-dom.ru/rest_srub/

http://profibrus.ru/kak-zamenit-nizhnie-vency-doma.html - как заменить сгнившие  венцы