Две картинки рядом, одна картинка для левого глаза, другая для правого. Собсно, из этих картинок делать проще простого: берёшь один слой и ставишь как правую, берёшь другой и как левую. В GIMP'е собирается очень быстро (собсно я уже сделал и даже проявлю наглость - пихну в свой блог, ссылочку на сюда обещаю).

Выгода - стационарную картинку можно рассматривать долго и в деталях.

ЗЫ: Один только вопрос: как это делали изначально? Туманности реальные, но снять их на стерео невозможно, нужна база минимум до орбиты Юпитера (а лучше - большая полуось орбиты Седны), а таких телескопов ещё не запускали.