Река Башкаус - левый приток реки Чулышман. Длина Башкауса составляет 219 км, площадь бассейна 7770 км2. Река Башкаус берёт начало из карового озера, расположенного в восточной части Курайского хребта.


В нижнем течении Башкаус протекает в узкой долине, часто переходящей в скалистое ущелье. Среднегодовой расход воды около 30 м3/сек.