То что сценарий создал профессиональный писатель-фантаст, уже говорит о том, что разработчики достаточно высоко подняли планку. Продуманность сюжета, удивительные «декорации», внешний вид монстров это, конечно, общая заслуга коллектива, но без тщательной сюжетной проработки видеоигра вряд ли стала бы столь увлекательной. И здесь мы, как раз таки, получаем характерный пример симбиоза фантастики и хоррора. Уход жанра от классической научно-социальной основы позволил перенести «ужас» за пределы Земли, хотя на ранних этапах формирования жанра всё было наоборот. Достаточно вспомнить «Туман» С. Кинга. Главный герой Doom, простой солдат без страха и упрёка, начинает выполнять свою роль с первых минут действия. Ему не повезло, что прилёт на Марс совпал со странными и жуткими событиями, которые предопределили его дальнейшую судьбу. Доктор Малькольм Бетругер, попавший под влияние демонов (странных голосов) открывает портал в Ад, из которого на марсианскую базу выползают полчища тварей. И на всём протяжении видеоигры несчастный десантник, фактически в одиночку противостоит армии демонов и других кровожадных тварей.

И действительно, человек впервые запустивший видеоигру, сразу же погружается в атмосферу загадочности и тревоги. Полумрак или совершенно тёмные участки марсианской базы, по которым вынужден бродить десантник, заведомо безпроигрышный вариант. Одно то обстоятельтво, что в тёмном углу может скрываться враг, заставляет подумать лишний раз, прежде чем сделать первый шаг. Начало игры, безусловно, интригует. Действие происходят на Марсе, и это настраивает на соотвествующее восприятие вселенной Doom, а намёки на то, что под базой расположен археологический раскоп со следами погибшей цивилизации, делает игровой процесс ещё более занимательным. Переход от одной локации к другой, сопровождается непрерывным сбором информации, причём это происходит вплоть до эпилога, когда главный персонаж заберёт последний КПК. Конечно, некоторые возразят, что получение полезных сведений выглядит однообразно, и тем не менее, это не только не напрягает, а наоборот увлекает, поскольку даёт возможность узнать побольше об исследованиях проводимых на базе, не говоря уже о заветных кодах, для запертых шкафов и дверей.

Сюжет видеоигры фантастичен во всех отношениях, отчасти он повторяет наработки сценаристов для предыдущих версий и концептуально почти не отличается. Главный персонаж космический десантник отправляется на Марс в сектор охраны и сразу же оказывается вовлечённым в поток бурно развивающихся событий. Но на этот раз разработчики подошли к написанию сценария более тщательно. Чтобы сделать сюжет более динамичным и фантастическим, был нанят профессиональный писатель-фантаст Мэтью Костелло, он же помогал создавать раскадровку игры. Но главная его заслуга состоит в создании атмосферы ужаса. И ведь всё действительно получилось. Doom 3, по степени саспенса, не уступает лучшим образцам фильмов ужасов. Не случайно в качестве канона были взяты «Ходячие мертвецы» Джорджа Ромеро.

В июне 2000 года Джон Кармак объявил о создании ремейка видеоигры Doom (до этого уже вышли 1 и 2 версии, которые стали популярными среди любителей виртуального хоррора), но свежая версия по задумке должна была стать вехой в индустрии игр, поскольку концентрировала все наработки компании iD, в частности новаторский метод рендеринга текстур и спец. эффектов. Разработка видеоигры шла в течении четырёх лет, что по современным меркам достаточно долго, но в итоге получился шедевр жанра. Мощный движок даже при достаточно низкой производительности компа, обеспечивал полное "вживление" в жуткий марсианский мир. А количество монстров и уровней, не давало расслабиться даже предвзятому любителю шутеров. В 2001 году игра впервые была продемонстрирована на выставке в Токио, а в 2002, там же в Японии, на экране кинотеатра продемонстрировали пятнадцатиминутное демо. Презентационный ролик ремейка заслужил пять наград. Но только 14 июля 2004 года Doom 3 была завершена окончательно.