Не надо путать Native SATA mode (AHCI) и native-mode контроллера SATA в режиме эмуляции PATA (не хватило у них оригинальности придумать отличающийся термин).

...

С этим забавная фишка в биосе -- если включить native-mode (или как они теперь говорят, "enhanced") на PATA и SATA, то биос в сетапе отображает Primary, Secondary и Third. Если же включить только на SATA, то Primary, Third и Fourth. ;) Смысла в этих названиях особого нет, всё равно от pri/sec-каналов IDE/SATA-контроллеров отталкиваться... так, эстетика. Не будут же в сетапе для среднестатистического туповатого американца писать вместо Third IDE Slave что-нть типа Bus0:Dev1E:Func2 82801FR/FRW SATA Controller Primary Slave. ;)

http://www.wasm.ru/forum/viewtopic.php?id=16740