— Я очень хотела работать в биоинформатике, потому что это самое достойное применение data science. Ведь мы занимаемся лечением и улучшением жизни людей, а не просто помогаем какой-то компании стать богаче, — объясняет Мария. — Сейчас мы работаем над лекарством от рака. В нашем достаточно трудном мире приятно делать работу, которая спасет жизни. Я считаю, что даже если наш проект не окажется успешным, это позволит другим командам приблизиться к решению проблем. Хотя бы потому, что им не придется повторять наши ошибки.

 

Израильское исследование, в котором участвует Мария, — это часть международного проекта под названием CAR T-REX. Название проекта обыгрывает англоязычное наименование динозавра Tyrannosaurus rex и медицинской технологии CAR-T. Ее сейчас применяют для борьбы против некоторых видов лейкозов и лимфом. То есть — против видов рака, атакующих кроветворную и иммунную системы.

 

Суть технологии в том, чтобы взять один из видов белых кровяных телец больного  – Т-клетки — и перепрограммировать их так, чтобы они атаковали опухоль.

 

Теоретически, то же лечение можно было бы применять не только против рака крови, но и против обычных опухолей. Но развитию технологии мешает, что переделанные Т-клетки плохо выживают в микроокружении опухоли. Кроме того, сама CAR-T опасна для пациентов. Применяют ее только тогда, когда ничто другое уже не помогает. Решению этих двух проблем и посвящен международный проект, в котором участвует Мария Дьякова.

 

«Наша задача —  сделать модифицированные Т-клетки более долгоживущими и более безопасными для пациентов. Одна из причин опасности – сам метод редактирования генов CRISPR Помимо вставок нужных генов в нужном месте, может сделать дополнительные вставки в разных других участках генома. И мы разрабатываем более безопасный аналог», — рассказывает Мария.

 

Ее нынешние израильские коллеги изначально искали биоинформатика. То есть, человека, умеющего пользоваться уже существующими программными инструментами в биомедицинских целях. Но, попав в проект, репатриантка решила применить data science и теперь обучает искусственный интеллект, который помогает в исследовании.

 

Например, мы знаем какие вещества производятся внутри иммунной клетки, работающей хорошо, а какие – внутри работающей плохо. Проанализировав много данных о том и другом, программа поможет выявить признаки здоровой и ослабленной клеток и подсказать решение.

 

Или, к примеру, другая задача. При редактировании генома новый ген надо куда-то вставить. И мест, куда именно его можно вставить, довольно много. Как выбрать подходящий участок? Раньше просто экспериментировали: редактировали геном в разных местах, получали новые клетки, проверяли результаты.

 

Но нейросеть может просто проанализировать множество разных случаев и подсказать совсем небольшое число потенциально работающих вариантов.

 

С приходом такого специалиста работа пошла быстрее. Проект рассчитан на 4 года, а длится уже полтора. И 80% задач за это время уже удалось выполнить.

 

Мария родом из Магнитогорска, уральского города, известного своим металлургическим комбинатом. В 2008 году она стала там чуть ли не первым человеком, занимающимся data science. Это сейчас нейросети у всех на слуху, а тогда очень многие считали их тупиковым направлением искусственного интеллекта и всячески отговаривали молодую сотрудницу.

 

В итоге она обучила программу для распознания дефектов на поверхности металла. Потом занималась прогнозированием спроса у крупных продавцов детской одежды. Но мечтала о биоинформатике. И поступила в соответствующую аспирантуру в МФТИ в подмосковном Долгопрудном.

 

Атмосфера в России становилась все хуже. Так что план был таков: сдать выпускные в 2022 году, дождаться, пока сын закончит первый класс, и репатриироваться. Начало большой войны заставило пересмотреть планы.

 

Семья быстро собралась и прилетела в Израиль уже в начале марта 2022 года. А через пару месяцев мама и сестра мужа прибыли по процедуре экстренной репатриации. Поселились, как и многие новые репатрианты, в Нетании. И потом пожалели – работа мечты нашлась в Реховоте.

Гарвард по выходным