Вот копилка советов:
нельзя ежегодно сажать лук на одном и том же месте;
нужно совмещать посевы лука и моркови;
замачивать лук-севок перед посадкой на полчаса в слабом растворе марганцовки;
мульчировать посев или посадку лука торфом;
опылять древесной золой;
опылять табачной пылью в чистом виде или пополам с известью либо золой;
табачная пыль + жгучий перец + зола;
грядку лука посыпать смесью соли и питьевой соды;
сажать рядом с грядками лука бархатцы;
после посадки лука-севка мульчировать грядку сухим навозом (помогает!);
полить раствором поваренной соли (200 гр на 10 л воды);
полить мыльным раствором (лучше использовать хозяйственное мыло);
посаженную грядку полить таким раствором : на ведро воды - 1 стакан соли и 2 столовые ложки керосина, полить очень осторожно, под луковичку;
смешать песок и нафталин и посыпать грядку.
Все эти народные способы утешительные. Но приходит новый огородный сезон, сажаем лук и начинается борьба с луковой мухой.

Кроме того, хорошо, если уже при посадке растений вы будете учитывать их обоюдно защищающие свойства.
С этой точки отлично сочетаются:
бархатцы - земляника, томат (от нематоды);
розы, тюльпаны, гладиолусы (от различных заболеваний);
бузина черная - смородина, крыжовник, яблоня (от клеща, огневки, пяденицы, плодожорки);
бузина красная - яблоня (от плодожорки, мух, мышей);
дельфиниум - все овощные культуры (от различных заболеваний);
календула - лук, тюльпаны, гладиолусы, пионы, ягодные кустарники (от нематоды, фузариоза, тли, малинной мухи, листогрызущих);
картофель - бобы, фасоль, капуста (от белянки, моли, тли, клещей, совки);
лук - морковь (защищают друг друга от мухи);
настурция - капуста (от капустниц), картофель (от фитофтороза), пионы (вирусные и грибковые болезни);
пижма - яблоня (от различных вредителей);
редис - салат (защищают друг друга);
редька - огурец, томат (от клеща);
рожь - картофель (от картофельной нематоды; посаженная осенью, оздоровит землю);
ромашка аптечная - шпинат (против большинства вредителей);
табак душистый - капуста, лук (от мухи);
сельдерей - капуста (от тли, белянки);
томаты - смородина, капуста (от тли, огневок, пилильщиков, листогрызущих);
укроп - капуста (от блошек);
фасоль белая - картофель (от колорадского жука);
хрен - капуста, репа, брюква (против килы);
черемуха - картофель (от фитофторы);
чеснок и лук - земляника (от гнилей);
картофель (от гнилей при хранении);
розы, тюльпаны, гладиолусы (от различных заболеваний);
чеснок - томаты (против фитофторы), капуста, редька (от крестоцветных блошек).