Правивший в то время король Мануэл I был вынужден обратиться за помощью к Венеции, перенесшей аналогичную эпидемию в 1485 году. Были отправлены посланники за мощами святого Роха, ставшего покровителем во время чумы в Италии. В марте 1506 года мощи были доставлены и для их хранения на месте захоронений началось строительство часовни.

Лишь через десять лет часовня была закончена и освещена во имя Святого Роха и тогда же из представителей всех сословий было организовано попечительское общество — Братство Святого Роха, существующее и поныне.

Первые иезуиты прибыли в Лиссабон в 1540 году по приглашению короля Жуана III. Временно располагаясь сначала в госпитале, потом в колледже, они обратились к королю с просьбой предоставить им часовню на кладбище.

Удовлетворив просьбу положительно, Жуан поставил условие — построить на этом месте большой храм, простой, но функциональный. Строительство храма по проекту придворного архитектора Альфонсо Альвареса началось в 1555 году.

Храм был закончен в 1619 году. Пышное внутреннее убранство с использованием слоновой кости, мрамора, ценных пород дерева получило название «иезуитский стиль».

В 1750-х годах на иезуитов начались гонения, они были обвинены в организации покушения на короля и изгнаны из страны. Храм был передан Общине Милосердия, чья церковь была разрушена в результате лиссабонского землетрясения в 1755 году. Сама же церковь Святого Роха была защищена своим святым от разрушений и от стихии практически не пострадала.

С первого мгновения при входе внутрь храма понимаешь, что попал в золотой ларец, от обилия позолоты начинает рябить в глазах и лишь присмотревшись, понимаешь, что покинуть это уникальное сооружение будет крайне сложно - невероятное количество деталей, резьба, позолота, мрамор, азулежу, драгоценные камни.

Храм состоит из восьми основных приделов, каждый из которых не похож на другой.

Часовня Святого Роха находится как раз на месте первоначально построенной часовни. Часовня выполнена в уникальной манере: золотые элементы убранства на белом фоне. Фигура Святого Роха вырезана из мягкого дерева и согласно преданиям ее высота (140 см) соответствует росту Святого Роха.