Скорей всего они не пропали, а просто лежат в архивах. Сообщения за последний месяц лежат в каталоге "last" все остальные разложенны по месяцам. Например прислано сообщение в мае 2015 года, значит искать его надо в каталоге 2015_05, а если сообщение прислано в апреле 2014 - искать его надо в 2014_04 и т.д. Возможно это и была причина изменить оформление личной переписки, у каждого есть свои плюсы и минусы, но не будем дискутировать о том что лучше, что хуже. Раз уж так получилось, пользуйтесь пока этой возможностью, хорошо что хоть эта возможность осталась, ну и надейтись на скорейшее востоновление привычного оформления.